Виділення ДНК з листків дорослих рослин за методикою з буфером на основі СТАВ. Схема створення геномно-заміщеного амфідиплоїда Авротика та його очікуваний геномний склад. Перенесення мікросателітних локусів між хромосомами в межах гомеологічної групи.
При низкой оригинальности работы "Порівняння хромосом 5-ї гомеологічної групи аврори та авротики з використанням специфічних мікросателітів", Вы можете повысить уникальность этой работы до 80-100%
ЕВОЛЮЦІЯ ГЕНОМІВ У ПРИРОДІ ТА ЕКСПЕРИМЕНТІ 1 1 Національний університет «Києво-Могилянська Академія» МОН України, Україна, 04070, м. 2 Канадський інститут сільського господарства і продовольства.Та всі його 7 пар А-хромосом увійшли до складу геномно-заміщеного амфідиплоїда Авротика (ААВВТТ) на додаток до тетраплоїдного компоненту АВ сорту мякої пшениці Аврора [2]. Метою нашої роботи було вивчити хромосоми цієї групи Аврори (AABBDD) та Авротики щодо можливості використання мікросателітних локусів, специфічних до хромосом 5A, 5B, 5D, для ідентифікації чужинних включень з геному Т. Виходячи із специфічності перевірених SSR-локусів до кожної з хромосом 5-ї гомеологічної групи пшениці [6-8] та з геномного складу Авротики, який випливає з її походження (рис. Спектри ампліфікації з праймерами, специфічними для хромосом 5А та 5В, не повинні розрізнятися для Аврори і Авротики, оскільки ці геноми у зазначених генотипах мають бути однаковими (рис. З праймерами, специфічними для хромосоми 5D, суворо кажучи, продуктів з ДНК Авротики утворюватися неповинно, оскільки замість генома D вона має геном Т (рис.Порівняльний мікросателітний аналіз генотипів мякої пшениці (AABBDD) та отриманого через обєднання її тетраплоїдного компонента ААВВ та геному ТТ Ae. mutica геномно-заміщеного амфідиплоїда із застосуванням праймерів мікросателітних локусів, картованих на хромосомах А, В та D геномів, підтвердив можливість використання вказаних SSR-локусів для ідентифікації у геномі амфідиплоїда хроматину 5-ої хромосоми іншого геному (Т).
Вывод
Порівняльний мікросателітний аналіз генотипів мякої пшениці (AABBDD) та отриманого через обєднання її тетраплоїдного компонента ААВВ та геному ТТ Ae. mutica геномно-заміщеного амфідиплоїда із застосуванням праймерів мікросателітних локусів, картованих на хромосомах А, В та D геномів, підтвердив можливість використання вказаних SSR-локусів для ідентифікації у геномі амфідиплоїда хроматину 5-ої хромосоми іншого геному (Т). Із 112 вивчених локусів, специфічних для трьох хромосом 5-ої гомологічної групи, виявлено 13, які мають діагностичну цінність для ідентифікації хроматину хромосоми 5Т за умов наявності у геномі інших хромосом тієї самої гомеологічної групи: Xcfd189, Xcfd102, Xgwm190, Xgwm272, Xgwm182, Xgdm68(A,B), Xgwm293(A,B), Xwmc289(B), Xgwm544, Xcfd7, Xwmc160, Xcfa2141(D), Xcfd40. Діагностична значущість полягає у наявності у спектрі ампліконів Авротики, що утворюються з праймерами вказаних локусів, компонентів, які ясно відрізняються за рухливістю від ампліконів, що утворюються з ДНК Аврори. Локуси Xcfd57 та Xcfa2141(A) мають обмежене значення для вивчення інтрогресивних ліній Авротика/Аврора через відсутність амплікону, характерного для ДНК з хромосомою 5Т. Крім того, 12 SSR-локусів з 22, локалізованих на хромосомі 5D, матимуть обмежене значення для ідентифікації інтрогресій D/T у сполученні з іншими хромосомно-специфічними молекулярно-генетичними маркерами.
Список литературы
1. Badaeva E.D., Friebe, B., Gill, B.S. Genome differentiation in Aegilops L. Distribution of highly repetitive DNA sequences on chromosomes of diploid species // Genome. - 1996. - 39. - P. 293-306.
2. Жиров Е.Г. Геномы пшеницы: исследование и перестройка: Дис. … докт. биол. наук: 03.00.15. - Краснодар. - 1989. - 366 с.
3. Єфіменко Т.С., Антонюк М.З., Мартиненко В.С. Створення чужинно-заміщених та чужинно-доданих ліній Triticum aestivum / Aegilops mutica // Фактори експериментальної еволюції організмів. Збірник наукових праць. - Київ: Логос, 2013. - 12. - С. 114-118
4. Vagujfalvi A., Galiba G., Cattivelli L. Dubcovsky J. The cold-regulated transcriptional activator Cbf3 is linked to the frost-tolerance locus Fr-A2 on wheat chromosome 5A // Molecular and General Genetics. - 2003. - 269, N 1. - P. 60-67.
5. Toth B., Galiba G., Feher E., Sutka J., Snape J.W. Mapping genes affecting flowering time and frost resistance on chromosome 5B of wheat // Theor. Appl. Genet. - 2003. - 107, N 3. - P. 509-514.
51
6. GRAINGENES: A Database for Triticeae and Avena [Електронний ресурс]. - http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml
8. Somers D.J., Isaac P, Edwards K. "A high-density microsatellite consensus map for bread wheat" // Theor Appl Genet. - 2004. - 109. - P. 1105-1114.
9. Jones J.K., Majisu B.N. The homoeology of Aegilops mutica chromosomes. // Canadian Journal of Genetics and Cytology. - 1968. - 10, N 3. - P. 620-626.
10. Ohta S. Phylogenetic relationship of Aegilops mutica Boiss. with the diploid species of congeneric Aegilops-Triticum complex, based on the new method of genome analysis using its B-chromosomes // Mem. Coll. Agric.Kyoto Univ. - 1991. - N 137. - P. 1-116.
IEFIMENKO T.S. 1, FEDAK G. 2, ANTONYUK M.Z. 1, TERNOVSKA T.K. 1 1 National University of “Kyiv-Mohyla Academy”, Ukraine, 04070, Kyiv, Skovorody str., 2, e-mail: centaureinae@gmail.com
2 Agriculture and Agri-Food Canada. Eastern Cereal and Oilseed Research Center, Ottawa, Ontario
COMPARISON OF GROUP 5 CHROMOSOME OF AURORA AND AUROTICA USING SPECIFIC MICROSATELITES
Aims. Determine the possibility to use microsatellite loci specific to chromosomes of homeologous group 5-th for distinction of Aurora (AABBDD) and Aurotica (AABBTT) chromosomes. Methods.PCR with primers specific to SSR loci mapped at chromosomes 5А, 5В, and 5D. Results. From 112 studied SSR loci specific to 3 homeologous chromosomes of group 5, 13 loci were selected as diagnostically valuable for identification of 5T chromosome fragments in conditions when other homeologous chromosomes of the same group are present in the genome. Conclusions. Microsatellite loci specific to 5А, 5В, and 5D common wheat chromosomes can be used for identification of alien chromatin of chromosome 5T in the genome of amphidiploid.
КОХАНЕНКО А.А., АРТЕМОВ Г.Н., НЕМИРОВИЧ-ДАНЧЕНКО Н.М., СТЕГНИЙ В.Н. Томский государственный университет, Россия, 634050, г. Томск, пр. Ленина, 36, е-mail: alinakokhanenko@gmail.com
ОРГАНИЗАЦИЯ ПОЛОВОЙ ХРОМОСОМЫ XL В ПРОСТРАНСТВЕ ЯДЕР ТРОФОЦИТОВ В ХОДЕ ПОЛИТЕНИЗАЦИИ У ВИДОВ DROSOPHILA ПОДГРУППЫ «MELANOGASTER» С КАРДИНАЛЬНЫМИ РАЗЛИЧИЯМИ В АРХИТЕКТУРЕ ЯДЕР
Пространственная организация хромосом в ядре - один из разделов современной клеточной биологии, который получил широкое распространение и весьма актуален в современной клеточной биологии. Сегодня молекулярные биологи выделяют, покрайней мере, три механизма, которыми может осуществляться регуляция активности генома. Они тесно связаны между собой: Первый механизм осуществляется посредством транскрипционных факторов, которые способны связываться с определенными последовательностями генома [1]; Второй регуляторный механизм включает метилирование ДНК и пост- трансляционную модификацию гистонов [2]; Третьим механизмом регуляции генов является определенная организация хромосом в пространстве ядра. Первые два механизма довольно широко изучены по отношению дифференциации эмбриональных стволовых клеток, в то время, как относительно третьего фактора известно очень немного. Пространственная организация и функционирование ядра обеспечиваются наличием двух типов связей - хромосомно-мембранных и межхромосомных [3-5]. Крупномасштабные хромосомные перемещения регулируют генную экспрессию путем
52
Вы можете ЗАГРУЗИТЬ и ПОВЫСИТЬ уникальность своей работы
