Применение микросателлитных локусов в изучении популяционно-генетического разнообразия древесных растений. Анализ генетического полиморфизма дуба черешчатого (Quercus robur L.) в популяциях Донецкого кряжа по четырем ядерным микросателлитным локусам.
При низкой оригинальности работы "Полиморфизм дуба черешчатого (Quercus robur L.) на Донецком кряже по микросателлитным локусам", Вы можете повысить уникальность этой работы до 80-100%
The small genome of Arabidopsis contains at least six expressed ?-tubulin genes // Plant Cell. The Plant Cytoskeleton: Key Tool for Agro-Biotechnology.Flax (Linum usitatissimum) is the most important industrial crop that covers human needs in the cellulose-rich fibers of high quality. Using Arabidopsis tubulin genes we have performed the similarity search of genes via TBLASTN predicted proteins of the Linum genome available at Phytozome v9.1. Results. Using CLUSTALW software we have made a multiple amino acid sequence alignment of the tubulin type specific regions of these genes with the sequences of Arabidopsis tubulin genes and obtained a phylogenetic tree for these sequences. 17 локуса, т.е. определить является ли исследуемая особь гомо-или гетерозиготной по этому локусу. Однако применение микросателлитов в анализе генетической изменчивости Q. robur в ряде случаев затруднено изза присутствия в популяциях по многим локусам null-аллелей, которые не амплифицируются [7].На Донецком кряже Q. robur отличается высоким уровнем генной множественности и средним уровнем генного разнообразия.
Вывод
На Донецком кряже Q. robur отличается высоким уровнем генной множественности и средним уровнем генного разнообразия. Необходимы более детальные исследования популяционно-генетического разнообразия Q. robur как в степной зоне юго-востока Украины, так и в пределах всей украинской части ареала для создания генетических резерватов. Для таких исследований эффективными могут быть ядерные микросателлитные локусы.
Список литературы
1. Petit R.J., Csaikl U.M., Bordбcs S., Burg K., Coart E., Cottrell J., Van Dam B., Deans J.D., Dumolin-Lapиgue S., Fineschi S., Finkeldey R., Gillies A., Glaz I., Goicoechea P.G., Jensen J.S., Kцnig A.O., Lowe A.J., Madsen S.F., Mбtyбs G., Munro R.C., Olalde M., Pemonge M.-H., Popescu F., Slade D., Tabbener H., Taurchini D., Sven de Vries G.M., Ziegenhagen B., Kremer A. Chloroplast DNA variation in European white oaks // For. Ecol. Manag. -
2002. - 156, № 1-3. - P. 5-26.
2. Buschbom J., Yanbaev Y., Degen B. Efficient Long-Distance Gene Flow into an Isolated Relict Oak Stand // J. of Heredity. - 2011. - 102, № 4. - P. 464-472.
3. Семериков Л.Ф. Изменчивость дуба черешчатого (Quercus robur L.) на восточной границе ареала // Экология. - 1976. - № 5. - С. 13-21.
4. Kremer A., Petit R.J. Gene diversity in natural populations of oak species // Ann. Sci. For. - 1993. - 50 (Suppl. 1 “Genetics of Oaks”). - P. 186-202.
5. Hampe A., Pemonge M.-H., Petit R.J. Efficient mitigation of founder effects during the establishment of a leading-edge oak population // Proc. Biol Sci. - 2013. - 280, № 1764. - P. 20131070.
6. Muir G., Schlцtterer C. Evidence for shared ancestral polymorphism rather than recurrent gene flow at microsatellite loci differentiating two hybridizing oaks (Quercus spp.) // Mol. Ecol. - 2005. - 14, № 2. - Р. 549- 561.
7. Kampfer S., Lexer C., Glцssl J., Steinkellner H. Characterization of (GA)n microsatellite loci from Quercus robur // Hereditas. - 1998. - 129, № 2. - P. 183-186.
8. Ballian D., Belletti P., Ferrazzini D., Boguni F., Kajba D. Genetic variability of Pedunculate Oak (Quercus robur L.) in Bosnia and Herzegovina // Periodicum Biologorum. - 2010. - 112, № 3. - P. 353-362.
9. Aldrich P.R., Michler C.H., Sun W., Romero-Severson J. Microsatellite markers for northern red oak (Fagaceae: Quercus rubra) // Mol. Ecol. - 2002. - 2, № 4. - P. 472-474.
11. Peakall R., Smouse P. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. - 2006. - 6. - P. 288-295.
12. POPGENE [Електронний ресурс]. - Режим trialпа: http://www.ualberta.ca/~fyeh/popgene_download.html
13. Aldrich P.R., Jagtap M., Michler C.H., Romero-Severson J. Amplification of North American red oak microsatellite markers in European white oaks and Chinese chestnut // Silvae Genet. - 2003. - 52, № 3-4. - P. 176-179.
14. Neophytou C., Aravanopoulos F., Fink S., Dounavi A. Detecting interspecific and geographic differentiation patterns in two interfertile oak species (Quercus petraea (Matt.) Liebl. and Q. robur L.) using small sets of microsatellite markers // For. Ecol. Manag. - 2010. - 259, № 10. - P. 2026-2035.
15. Cottrell J.E., Munro R.C., Tabbener H.E., Milner A.D., Forrest G.I., Lowe A.J. Comparison of fine-scale genetic structure using nuclear microsatellites within two British oakwoods differing in population history // For. Ecol. Manag. - 2003. - 176, № 1-3. - P. 287-303.
16. Vranckx G., Jacquemyn H., Mergeay J., Cox K., Kint V., Muys B., Honnay O. Transmission of genetic variation from the adult generation to naturally established seedling cohorts in small forest stands of pedunculate oak (Quercus robur L.) [Електронний ресурс] // For. Ecol. Manag. - 2013. - Режим доступа: http://dx.doi.org/10.1016/j.foreco.2013.10.027
17. Каган Д.И. Популяционно-генетическая структура дуба черешчатого в лесосеменных плантациях и насаждениях Белорусского Полесья: автореф. дис. на соискание уч. степени кандидата биол. наук: спец. 06.03.01 «Лесные культуры, селекция, семеноводство». - Гомель, 2012. - 23 с.
18. Ковалевич О.А. Геногеография дуба черешчатого на территории Беларуси по данным анализа хлоропластной ДНК: автореф. дис. на соискание уч. степени кандидата биол. наук: спец. 06.03.01 «Лесные культуры, селекция, семеноводство». - Гомель, 2013. - 24 с.
19. Габитова А.А. Дуб черешчатый (Quercus robur L.) на Южном Урале: эколого-генетический анализ популяционной структуры: автореф. дис. на соискание уч. степени кандидата биол. наук: спец. 03.02.08 «Экология» (биологические науки) и 03.02.07 «Генетика». - Уфа, 2012. - 18 с.
20. Муллагулов Р.Ю., Редькина Н.Н., Янбаев Ю.А. Аллозимная изменчивость дуба черешчатого Quercus robur L. (Fagaceae) в изолированных популяциях на восточной границе ареала // Вестник ОГУ. - 2008. - № 81. - С. 107-110.
DEMKOVYCH A.YE., KORSHIKOV I.I., MAKOGON I.V. Donetsk Botanical Garden, National Academy of Sciences of Ukraine, Ukraine, 83059, Donetsk, Pr. Illicha, 110, е-mail: dbsgenetics@gmail.com
POLYMORPHISM OF QUERCUS ROBUR L. INVESTIGATED BY MISROSATELLITE LOCI IN DONETSKIY KRYAZH
Aims. Analysis of tree genetic polymorphism at four NSSR loci in two highland populations of Quercus robur L. in Donetskiy Kryazh. Methods. To determine plant genotype, we used electrophoretic analysis in polyacrylamide gel of PCR-products of four NSSR loci. Results. There were detected 2 to 9 (total 24) alleles at the investigated loci. Observed heterosigosity (HO) = 0.22, expected (HE) = 0.47. A significant excess of homozygous genotypes was detected. Conclusions. Microsatellite loci provide more exact determination of the allele diversity and heterozygosity of Q. robur.
Институт физиологии растений и генетики НАН Украины, Украина, 03022, г. Киев, ул. Васильковская, 31/17, e-mail: zhuk_bas@voliacable.com
ЭВОЛЮЦИЯ СИГНАЛЬНЫХ СИСТЕМ ФИТОГОРМОНОВ РАСТЕНИЙ
В процессе эволюции растительных организмов сформировались сложные сигнальные системы, координирующие экспрессию генов, клеточную активность в процессе роста и развития, формирование ответа на стресс [1]. Критической детерминантой эволюции наземных растений является необходимость формирования органов для
21
Вы можете ЗАГРУЗИТЬ и ПОВЫСИТЬ уникальность своей работы
