Использование принципов работы с эластичной сетью для оценки поведения структуры молекулярной машины во время динамического цикла. Основные топологические характеристики для эластичной сети, построенной на основе исследуемой молекулярной машины.
1. Теоретические основы 1.1 Сети, их архетипы 1.2 Эластичные сети и молекулярные машины 2. Используя понятие эластичной сети можно провести анализ характеристик для динамических молекулярных структур, которые называются молекулярные машины [1]. Используя принципы работы с эластичной сетью можно провести оценку поведения структуры молекулярной машины во время динамического цикла. Данное исследование предполагает оценку топологических характеристик для эластичной сети, построенной на основе исследуемой молекулярной машины. Теоретические основы 1.1 Сети, их архетипы В общем случае случайная сеть представляет собой модель, в которой некоторый набор параметров принимают фиксированные значения, а другие являются случайными [2,3]. Строго говоря случайная модель сети не определена в терминах единственной произвольно генерируемой сети, а представляет собой совокупность сетей, то есть в котором каждая из сетей имеет определенную вероятность реализации, что значит, что каждая сеть ансамбля имеет свой собственный статистический вес. Самым простейшим примером случайной сети является классический случайный граф Эрдеша-Реньи, где в статистическом ансамбле все возможные графы с числом узлов n и количеством связей m имеют одинаковый статистический вес реализации. Еще одной важной глобальной характеристикой сети является кратчайшая длина пути. Для вычисление пуассоновского случайного графа используется понятие коэффициента кластеризации, которая является мерой транзитивности в сети и определяет вероятность того, что двое соседей узла являются соседями друг друга [3-5]. Данная характеристика была описана Л. Фриманом в своей работе по описанию мер центральностей узлов сети в 1977 году. В результате исследований эластичной сети и динамики выяснилось, что самые медленные движения для миозиновой структуры описываются двумя выделенными модами, которые отделены от основного спектра мод спектральной щелью.
Вы можете ЗАГРУЗИТЬ и ПОВЫСИТЬ уникальность своей работы
