Генотипирование новых перспективных технических протоклонов винограда с использованием микросателлитных маркеров - Статья

В связи с ошибками полимеразы во время репликации ДНК, локусы породили множество аллелей, которые отличаются по длине изза различного количества повторов последовательности. В блоке «Алиготе» контрольным образцом был использован типичный по фенотипу протоклон Алиготе 7-7; протоклон Алиготе 7-10 по микросателлиту VRZAG62 отличается от предыдущего на 10 нуклеотидов по обоим локусам, по VRZAG79 на 16 нуклеотидов, не отличается по VVS2, на 30 и 22 нуклеотида по VVMD5, на 15 нуклеотидов по VVMD7, а аллель VVMD27 не амплифицировалась у Алиготе 7-10 (рис. От него по локусу VRZAG62 протоклон Мерло 10-8 не отличается, протоклон Мерло 10-9 отличается но 8 и 4 нуклеотида, по локусу VRZAG79 Мерло 10-8 отличается на 35 и 15 нуклеотидов, Мерло 10-9 отличается на 23 и 27 нуклеотидов, по локусу VVS2 Мерло 10-8 отличается на 15 и 24 нуклеотида, Мерло 10-9 отличается 8 и 6 нуклеотидами, по локусу VVMD5 Мерло 10-8 отличается на 9 нуклеотидов, Мерло 10-9 отличается на 7 нуклеотидов, по локусу VVMD7 Мерло 10-8 отличается на 4 нуклеотида, Мерло 10-9 отличается на 8 нуклеотидов, по локусу VVMD27 Мерло 10-8 отличается на 14 и 16 нуклеотидов, как и Мерло 10-9. 11-12) отличается от протоклона Солярис 70-21 на 6 и 14 нуклеотидов по локусу VRZAG62, по локусу VRZAG79 отличается на 46 и 37 нуклеотидов, по локусу VVS2 отличается на 11 нуклеотидов, по локусу VVMD5 отличается на 23 и 21 нуклеотид, по локусу VVMD7 отличается на 17 нуклеотидов и по локусу VVMD27 отличается на 6 и 16 нуклеотидов. От контрольного образца по локусу VRZAG62 отличаются протоклон Каберне-Совиньон 210-4 на 12 нуклеотидов, Каберне-Совиньон 210-8 отличается на 10 и 14 нуклеотидов, Каберне Мысхако (К-С 15) отличается на 6 и 10 нуклеотидов, Кабернек отличается на 8 и 8 нуклеотидов, по локусу VRZAG79 Каберне-Совиньон 210-4 отличается на 28 и 38 нуклеотидов, Каберне-Совиньон 210-8 отличается на 20 и 20 нуклеотидов, Каберне Мысхако (К-С 15) отличается на 33 и 33 нуклеотида, Кабернек отличается на 18 и 5 нуклеотидов, по локусу VVS2 Каберне-Совиньон 210-4 отличается на 11 и 4 нуклеотидов, Каберне Мысхако (К-С 15) отличается на 17 и 21 нуклеотид, по локусу VVMD5 Каберне-Совиньон 210-4 отличается на 9 нуклеотидов, Каберне-Совиньон 210-8 отличается на 4 нуклеотида, Каберне Мысхако (К-С 15) отличается на 32 и 12 нуклеотидов, Кабернек отличается на 4 нуклеотида, по локусу VVMD7 Каберне-Совиньон 210-4 отличается на 8 нуклеотидов, Каберне-Совиньон 210-8 отличается на 4 и 23 нуклеотида, Каберне Мысхако (К-С 15) отличается на 14 нуклеотидов, Кабернек не отличается, по локусу VVMD27 образцы также идентичны.По результатам многолетнего ампелографического скрининга технических популяций вышеназванных десяти сортов винограда и подкрепленного молекулярно-генетического анализа их выделенных протоклонов на государственные испытания в разные годы были переданы сорта-клоны Алиготе фанагорийское, Каберне Мысхако, Каберне фанагорийский, Мерло фанагорийский, Пиногрик, Пинок белый, Пинофагр и Совиньон фанагорийский [4-5].

сорт клон генетический маркер

По результатам многолетнего ампелографического скрининга технических популяций вышеназванных десяти сортов винограда и подкрепленного молекулярно-генетического анализа их выделенных протоклонов на государственные испытания в разные годы были переданы сорта-клоны Алиготе фанагорийское, Каберне Мысхако, Каберне фанагорийский, Мерло фанагорийский, Пиногрик, Пинок белый, Пинофагр и Совиньон фанагорийский [4-5].

1. Звягин А.С. Выделение ДНК из гербарных листьев Vitis vinifera / Звягин А.С. // Научный журнал КУБГАУ. 2010. № 58 (04).

2. Милованов А.В. Выделение ДНК при помощи peqgold plant dna mini kit / А.В. Милованов, Л.П. Трошин // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КУБГАУ) [Электронный ресурс]. Краснодар: КУБГАУ, 2013. № 06 (090). С. 167 - 176. IDA [article ID]: 0901306011. Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2013/06/pdf/11.pdf, 0,625 у.п.л., импакт-фактор РИНЦ=0,581.

3. Милованов А.В. Генотипирование сортов винограда по молекулярным маркерам / А.В. Милованов, Л.П. Трошин // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КУБГАУ) [Электронный ресурс]. Краснодар: КУБГАУ, 2014. №02(096). С. 53 - 65. IDA [article ID]: 0961402005. Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2014/02/pdf/05.pdf, 0,812 у.п.л., импакт-фактор РИНЦ=0,346.

4. Трошин Л.П. Ампелографическая и селекционная научно-исследовательская работа Кубанского госагроуниверситета / Л.П. Трошин // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КУБГАУ) [Электронный ресурс]. Краснодар: КУБГАУ, 2012. № 07 (081). С. 524 - 544. IDA [article ID]: 0811207039. Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2012/07/pdf/39.pdf, 1,312.

5. Трошин Л.П., Радчевский П.П. Виноград: иллюстрированный каталог. Районированные, перспективные, тиражные сорта. Ростов н/Д: Феникс, 2010. 271 с.: ил. (Мир садовода).

6. Ajitpal Singh, Krishan Kumar, MANAVINDRA Singh Gill1, Parveen Chhuneja, Naresh Kumar Arora and Kuldeep Singh. Genotype identification and inference of genetic relatedness among different purpose grape varieties and rootstocks using microsatellite markers // African Journal of Biotechnology, 9 January 2013. Vol. 12 (2). P. 134-141.

7. Bowers J.E., Dangl G.S. and Meredith C.P. Development and characterization of additional microsatellite DNA markers for grape // Am. J. Enol. Vitic. 1999. V. 50, № 30. P. 243-246.

8. Bowers J.E., Dangl G.S., Vignani R. and Meredith C.P. Isolation and characterization of new polymorphic simple sequence repeat loci in grape (Vitis vinifera L.) // Genome. 1996. V. 39. P. 628-633.

9. Regner F., Hack R. and Santiago J. L. Highly variable Vitis microsatellite loci for the identification of Pinot Noir clones // HBLA u. BA fur Wein und Obstbau, Klosterneuburg, Austria. Vitis, 45 (2), 85-91 (2006).

10. Zulini L., Russo M. and Peterlunger E. Genotyping wine and table grape cultivars from Apulia (Southern Italy) using microsatellite markers // Dipartimento di Produzione Vegetale e Tecnologie Agrarie (Universita di Udine, Udine, Italia). Vitis, 41 (4), 183-187 (2002).

11. Maria Stella Grando, Claudia Frisinghelli. Grape microsatellite markers: Sizing of DNA alleles and genotype analysis of some grapevine cultivars // Istituto Agrario di San Michele all"Adige (San Micheleall"Adige, Italia). Vitis, 37 (2), 79-82 (1998).

12. Sefc K.M., Regner F., Tureschek E., Glossl J. and Steinkellner H. Identification of microsatellite sequences in Vitis riparia and their application for genotyping of different Vitis species // Genome. 1999. V. 42. P. 367-373.

13. Thomas M.R. and Scott N.S. Microsatellite repeats in grapevine reveal DNA polymorphism when analysed as sequence-tagged sites (STSS) // Theor. Appl. Genet. 1993. V. 86. P. 985-990.

14. Thomas M.R., Matsumoto S., Cain P. and Scott N.S. Repetitive DNA of grapevine: classes present and sequences suitable for cultivar identification // Theor. Appl. Genet. 1993. V. 86. P. 173-180.

Размещено на .ru