Генетическое разнообразие и эволюция Mycobacterium Tuberculosis - Автореферат

Созданная и обновляемая глобальная база данных по 11 локусам VNTR штаммов M. tuberculosis Beijing (1853 штамма на 30.06.2009) эффективно применяется для филогенетических исследований и эпидемиологического мониторинга циркуляции штаммов этого генотипа. Поиск опубликованных данных по 11 локусам MIRU-VNTR ## 2, 4, 10, 16, 23, 24, 26, 27, 31, 39, 40 (Supply et al., 2001) штаммов Beijing выявил 1302 штамма, включая и штаммы генотипированные в нашей лаборатории. Для получения целостного представления о структуре локуса DR штаммов, помимо стандартного набора из 43 спейсеров, мы провели анализ 25 "новых" спейсеров (van Embden et al., 2000), который выявил наличие 6 "новых" спейсеров (№№ 48, 49, 50, 66, 67, 68) у всех штаммов Beijing (Рис.2). В этой связи, мы дополнительно включили в наше исследование выборку ДНК 123 штаммов M. tuberculosis, выделенных в Пекине в 2003-2005 гг. Эти штаммы включали 40 чувствительных и 83 лекарственно-устойчивых штамма, большинство из которых (n=56) были мультирезистентными. Этот анализ выявил, что 27 (24%) штаммов имели интактный участок NTF и относились к древней линии внутри генотипа Beijing, в то время как 86 штаммов имели прямую инсерцию IS6110 в правом плече локуса NTF и относились к современной линии генотипа Beijing.Генотип Beijing возник на территории северного Китая более 2000 лет назад и проник в другие регионы мира из Юго-Восточной Азии: в Россию - в средние века, в Южную Африку с 17 века и в Австралию в конце 19 века. Генотип Beijing включает две крупные филогенетические линии ("древние" и "современные" штаммы), которые различаются по структуре локусов NTF, IS6110, IS1547 и Rv3135-PPE и особенностям развития лекарственной устойчивости. Субпопуляция варианта В0/Beijing отличается существенно более быстрым (в 10,6 раза) ростом в сравнении с популяцией Beijing в целом, что показывает "успешный" характер этого клонального варианта M. tuberculosis, распространенного в России.

1. Современная глобальная популяция M. tuberculosis генотипа Beijing характеризуется генетической неоднородностью и, в целом, сформировалась в результате человеческих миграций. Генотип Beijing возник на территории северного Китая более 2000 лет назад и проник в другие регионы мира из Юго-Восточной Азии: в Россию - в средние века, в Южную Африку с 17 века и в Австралию в конце 19 века.

2. Генотип Beijing включает две крупные филогенетические линии ("древние" и "современные" штаммы), которые различаются по структуре локусов NTF, IS6110, IS1547 и Rv3135-PPE и особенностям развития лекарственной устойчивости.

3. Субпопуляция варианта В0/Beijing отличается существенно более быстрым (в 10,6 раза) ростом в сравнении с популяцией Beijing в целом, что показывает "успешный" характер этого клонального варианта M. tuberculosis, распространенного в России.

4. Метод инвертированной IS6110-ПЦР пригоден для детекции штаммов M. tuberculosis генотипа Beijing и его двух основных филогенетических линий, а VNTR-типирование - для детекции и дифференциации штаммов кластера В0.

5. Разработанная минимальная схема VNTR-типирования на основе 7 локусов (QUB-11b, Mtub21, QUB-26, MIRU26, QUB-3232, VNTR-3820, VNTR-4120) эффективна для скринингового анализа штаммов M. tuberculosis Beijing. Сочетанное применение методов VNTR и IS6110-RFLP необходимо для высокоразрешающего типирования M. tuberculosis.

6. Разработанный метод мультиплексной аллель-специфической ПЦР для анализа основных мутаций резистентности в генах RPOB и KATG эффективен для выявления большинства мультирезистентных штаммов M. tuberculosis, циркулирующих в России и других странах с высоким уровнем заболеваемости туберкулезом.

7. Мутации резистентности в KATG315, EMBB306, и RPOB531 наиболее часто встречаются у штаммов генотипа Beijing в сравнении со штаммами других генотипов.

8. Мутации в гене EMBB306, выявленные у 30% штаммов M. tuberculosis, чувствительных к этамбутолу, не могут служить маркером устойчивости к этамбутолу.

9. Разработанные методологические подходы на основе применения комплекса информативных молекулярных маркеров могут быть использованы для проведения филогенетических и филогеографических исследований, эффективного мониторинга и диагностики лекарственной устойчивости циркулирующих штаммов M. tuberculosis.

Главы в монографиях: 1. Mokrousov I., T. Otten, B. Vishnevsky, O. Narvskaya. Molecular basis of anti-tuberculosis drug resistance and its genotypic detection in Russia // Trends in DNA fingerprinting research (ed. M. M. Read) - Nova Science Publishers. NY, USA. - 2005. - P.83-109.

2. Narvskaya O., Mokrousov I., Otten T., Vishnevsky B. Molecular markers: application for studies of Mycobacterium tuberculosis population in Russia // Trends in DNA fingerprinting research (ed. M. M. Read). Nova Science Publishers. NY, USA. - 2005. - P.111-125.

3. Valcheva V., Mokrousov I., Narvskaya O., Rastogi N., Markova N. Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis population in Bulgaria // Genetic Diversity (Eds. C. L. Mahoney, D. A. Springer). Nova Science Publishers. NY, USA. - 2009 - P.70-106.

4. Mokrousov I. Molecular basis of ethambutol resistance in Mycobacterium tuberculosis: current insights // Drug-Resistant Tuberculosis: Causes, Diagnosis and Treatments (Eds. S. Ng?y, Z. Kung). Nova Science Publishers. NY, USA. - 2009. - P.180-204.

5. Valcheva V., Markova N., Rastogi N., Narvskaya O., Mokrousov I. Drug Resistant Tuberculosis in Bulgaria: Molecular Insights // Drug-Resistant Tuberculosis: Causes, Diagnosis and Treatments (Eds: S. Ng?y, Z. Kung). Nova Science Publishers. NY, USA. - 2009. - P. 206-229.

Статьи в рекомендованных ВАК РФ журналах: 1. Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф., Вишневский Б.И. Генетическое маркирование полирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России // Пробл. Туберк. - 1999. - №3. - С.39-41.

2. Sola C., Filliol I., Legrand E., Mokrousov I., Rastogi N. Mycobacterium tuberculosis phylogeny reconstruction based on combined numerical analysis with IS1081, IS6110, VNTR and DR-based spoligotyping suggests the existence of two new phylogeographical clades // J. Mol. Evol. - 2001. - Vol.53. - P.680-689.

3. Sola C., Filliol I., Gutierrez M. C., Mokrousov I., Vincent V., Rastogi N. Spoligotype database of Mycobacterium tuberculosis: biogeographic distribution of shared types and epidemiologic and phylogenetic perspectives // Emerg. Infect. Dis. - 2001. - Vol.7. - P.390-396.

4. Sebban M., Mokrousov I., Rastogi N., Sola C. A data-mining approach to spacer oligonucleotide typing of Mycobacterium tuberculosis // Bioinformatics - 2002. - Vol.18. - P.235-243.

5. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Otten T., Vyshnevskiy B. Novel IS6110 insertion sites in the direct repeat locus of Mycobacterium tuberculosis clinical strains from the St. Petersburg area of Russia and evolutionary and epidemiological considerations // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol.40. - P.1504-1507.

6. Mokrousov I., Narvskaya O., Otten T., Limeschenko E., Steklova L., Vyshnevskiy B. High prevalence of KATG Ser315Thr substitution among isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from northwestern Russia, 1996 to 2001 // Antimicrob. Agents Chemother. - 2002. - Vol.46. - P.1417-1424.

7. Нарвская О.В., Вишневский Б.И., Елькин А.В., Мокроусов И.В., Лимещенко Е.В., Оттен Т.Ф., Осташко О.М., Ариэль Б.М. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных, оперированных по поводу туберкулеза легких // Пробл. Туберк. - 2002. - №3. - С.50-53.

8. Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Лимещенко Е.В., Стеклова Л.Н., Оттен Т.Ф., Вишневский Б.И. Характеристика циркулирующих на Северо-Западе России штаммов Mycobacterium tuberculosis с использованием сполиготипирования // Пробл. Туберк. - 2002. - №4. - С.44-48.

9. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Otten T., Vyshnevskiy B. Detection of ethambutol-resistant Mycobacterium tuberculosis strains by multiplex allele-specific PCR assay targeting EMBB306 mutations // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol.40. - P.1617-1620.

10. Mokrousov I., Filliol I., Legrand E., Sola C., Otten T., Vyshnevskaya E., Limeschenko E., Vyshnevskiy B., Narvskaya O., Rastogi N. Molecular characterization of multiple-drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from northwestern Russia and analysis of rifampin resistance using RNA/RNA mismatch analysis as compared to the line probe assay and sequencing of the RPOB gene // Res. Microbiol. - 2002. - Vol.153. - P.213-219.

11. Mokrousov I., Otten T., Filipenko M., Vyazovaya A., Chrapov E., Limeschenko E., Steklova L., Vyshnevskiy B., Narvskaya O. Detection of isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis strains by a multiplex allele-specific PCR assay targeting KATG codon 315 variation // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol.40. - P.2509-2512.

12. Narvskaya O., Otten T., Limeschenko E., Sapozhnikova N., Graschenkova O., Steklova L., Nikonova A., Filipenko M., Mokrousov I., Vyshnevskiy B. Nosocomial outbreak of multidrug-resistant tuberculosis caused by a strain of Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family in St. Petersburg, Russia // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2002. - Vol.21. - Vol.596-602.

13. Вишневский Б.И., Нарвская О.В., Мокроусов И.В., Истомин Е.А., Оттен Т.Ф. Чувствительность к левофлоксацину штаммов штаммов Mycobacterium tuberculosis с различным генотипом, выделенных от больных с впервые выявленным и хроническим туберкулезным процессом // Антибиот. Химиотер. - 2002. - Т.47. - №6 - С.31-33.

14. Mokrousov I., Otten T., Vyshnevskiy B., Narvskaya O. Detection of EMBB306 mutations in ethambutol-susceptible clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from Northwestern Russia: implications for genotypic resistance testing // J. Clin. Microbiol. - 2002. - Vol.40. - P.3810-3813.

15. Mokrousov I., Narvskaya O., Otten T., Vyazovaya A., Limeschenko E., Steklova L., Vyshnevskyi B. Phylogenetic reconstruction within Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in northwestern Russia // Res. Microbiol. - 2002. - Vol.153. - P.629-637.

16. Filliol I., Driscoll J. R., Van Soolingen D., Kreiswirth B. N., Kremer K., Valetudie G., Anh D. D., Barlow R., Banerjee D., Bifani P. J., Brudey K., Cataldi A., Cooksey RC, Cousins DV, Dale JW, Dellagostin OA, Drobniewski F, Engelmann G, Ferdinand S, Gascoyne-Binzi D, Gordon M, Gutierrez MC, Haas WH, Heersma H, Kallenius G, Kassa-Kelembho E, Koivula T, Ly HM, Makristathis A, Mammina C, Martin G, Mostrom P., Mokrousov I., et al. Global distribution of Mycobacterium tuberculosis spoligotypes // Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol.8. - P.1347-1349.

17. Вишневский Б.И., Нарвская О.В., Васильева С.Н., Сапожникова Н.В., Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф. Вирулентность микобактерий туберкулеза // Пробл. Туберк. - 2002. - №10. - С.33-36.

18. Mokrousov I., Otten T., Vyshnevskiy B., Narvskaya O. Allele-specific RPOB PCR assays for detection of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis in sputum smears // Antimicrob. Agents Chemother. - 2003. - Vol 47. - P.2231-2235.

19. Mokrousov I., Otten T., Vyazovaya A., Limeschenko E., Filipenko M., Sola C., Rastogi N., Steklova L., Vyshnevskiy B., Narvskaya O. PCR-based methodology for detecting multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis Beijing family circulating in Russia // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2003. - Vol.22. - P.342-348.

20. Filliol I., Driscoll J. R., van Soolingen D, Kreiswirth BN, Kremer K, Valetudie G, Dang DA, Barlow R, Banerjee D, Bifani P, Brudey K, Cataldi A, Cooksey RC, Cousins D, Dale J, Dellagostin OA, Drobniewski F, Engelmann G, Ferdinand S, Gascoyne-Binzi D, Gordon M, Gutierrez MC, Haas WH, Heersma H, Kassa-Kelembho E, Ho M, Makristathis A, Mammina C, Martin G, Mostrom P, Mokrousov I., et al. Snapshot of moving and expanding clones of Mycobacterium tuberculosis and their global distribution assessed by spoligotyping in an international study // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol.41. - P. 1963-1970.

21. Оттен Т.Ф., Нарвская О.В., Олейник В.В., Мокроусов И.В., Лимещенко Е.В., Вязовая А.А., Вишневский Б.И. Микробиологическая и молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных полиорганным и генерализованным туберкулезом // Пробл. Туберк. Болезн. Легк. - 2003. - №10. - С.44-47.

22. Сапожникова Н.В., Скворцова Л.А., Павлова М.В., Вишневский Б.И., Оттен Т.Ф., Васильева С.Н., Маничева О.А., Мокроусов И.В., Нарвская О.В. Туберкулез легких, вызванный Mycobacterium tuberculosis различных генотипов // Пробл. Туберк. Болезн. Легк. - 2003. - №10. - С.13-15.

23. Норкина О.В., Киншт В.Н., Мокроусов И.В., Курунов Ю.Н., Краснов В.А., Филиппенко М.Л. Генетическое разнообразие Mycobacterium tuberculosis и оценка факторов риска распространения заболевания туберкулезом в Сибирском регионе России методами молекулярной эпидемиологии // Мол. Генет. Микробиол. Вирусол. - 2003. - №3. - С.9-18.

24. Матракшин А.Г., Месько Е.М., Белякова Н.К., Андреевская С.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., Кузьмин А.В., Мокроусов И.В., Поспелов Л.Е. Генотипическая характеристика штаммов Mycobacterium tubercolosis из Республики Тыва // Пробл. Туберк. Болезн. Легк. - 2004. - №3. - С.37-40.

25. Mokrousov I. Multiple RPOB mutants of Mycobacterium tuberculosis and second-order selection // Emerg. Infect. Dis. - 2004. - Vol.10. - P.1337-1338.

26. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Vyazovaya A., Otten T., Vyshnevskiy B. Analysis of the allelic diversity of the mycobacterial interspersed repetitive units in Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing family: practical implications and evolutionary considerations // J. Clin. Microbiol. - 2004. - Vol.42. - P.2438-2444.

27. Mokrousov I., Bhanu N. V., Suffys P. N., Kadival G. V., Yap S. F., Cho S. N., Jordaan A. M., Narvskaya O., Singh U. B., Gomes H. M., Lee H., Kulkarni S. P., Lim K. C., Khan B. K., van Soolingen D., Victor T. C., Schouls L. M. Multicenter evaluation of reverse line blot assay for detection of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates // J. Microbiol. Methods. - 2004. - Vol.57. - P.323-335.

28. Оттен Т.Ф., Мокроусов И.В., Нарвская О.В., Вишневский Б.И. Возможности и перспективы микробиологической диагностики туберкулеза // Пробл. Туберк. Болезн. Легк. - 2004. - №5. - С.32-35.

29. Сурикова О.В., Войтих Д.В., Кузьмичева Г.А., Татьков С.И., Мокроусов И.В., Нарвская О.В., Филипенко М.Л. Дифференциация микобактерий туберкулеза семейства W-Beijing, распространенных на территории Российской Федерации, на основе VNTR-типирования // Мол. Генет. Микробиол. Вирусол. - 2005. - №3. - С.22-29.

30. Surikova O. V., Voitech D. S., Kuzmicheva G., Tatkov S.I., Mokrousov I. V., Narvskaya O. V., Rot M. A., van Soolingen D., Filipenko M. L. Efficient differentiation of Mycobacterium tuberculosis strains of the W-Beijing family from Russia using highly polymorphic VNTR loci // Eur. J. Epidemiol. - 2005. - Vol. 20. - P.963-974.

31. Mokrousov I., Ly H. M., Otten T., Lan N. N., Vyshnevskyi B., Hoffner S., Narvskaya O. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography // Genome Res. - 2005. - Vol.15. - P.1357-1364.

32. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Vyazovaya A. Efficient discrimination within a Corynebacterium diphtheriae epidemic clonal group by a novel macroarray-based method // J. Clin. Microbiol. - 2005. - Vol.43. - P.1662-1668.

33. Mokrousov I., Jiao W. W., Sun G. Z., Liu J. W., Li M., Narvskaya O., Shen A. D. Evaluation of the RPOB macroarray assay to detect rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis in Beijing, China // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2006. - Vol.25. - P.703-710.

34. Mokrousov I., Jiao W. W., Sun G. Z., Liu J. W., Valcheva V., Li M., Narvskaya O., Shen A. D. Evolution of drug resistance in different sub-lineages within Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype // Antimicrob. Agents Chemother. - 2006. - Vol.50. - P.2820-2823.

35. Mokrousov I., Jiao W. W., Valcheva V., Vyazovaya A., Otten T., Ly H. M., Lan N. N., Limeschenko E., Markova N., Vyshnevskiy B., Shen A. D., Narvskaya O. Rapid detection of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and its ancient and modern sub-lineages by IS6110-based inverse PCR // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol.44. - P.2851-2856.

36. Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and mycobacterial interspersed repetitive unit typing // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol.44. - P.1614.

37. Brudey K., Driscoll J. R., Rigouts L, Prodinger WM, Gori A, Al-Hajoj SA, Allix C, Aristimuno L, Arora J, Baumanis V, Binder L, Cafrune P, Cataldi A, Cheong S, Diel R, Ellermeier C, Evans JT, Fauville-Dufaux M, Ferdinand S, Garcia de Viedma D, Ly HM, Martin C, Martin C, Mokrousov I., et al. Mycobacterium tuberculosis complex genetic diversity: mining the fourth international spoligotyping database (SPOLDB4) for classification, population genetics and epidemiology // BMC Microbiol. - 2006. - Vol.6. - P.23

38. Мельникова Н.Н., Мокроусов И.В. Исследование резистентности к рифампицину L-форм микобактерий туберкулеза на основе анализа мутаций в гене RPOB //. Пробл. Туберк. Болезн. Легк. - 2006. - №11. - С.22-24.

39. Mokrousov I., Narvskaya O. Designation of major MIRU types within Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype // J. Clin. Microbiol. 2007. - Vol.45. - P.4092-4093.

40. Mokrousov I. Towards a quantitative perception of human-microbial co-evolution // Front. Biosci. - 2007. - Vol.12. - P.4818-4825.

41. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Vyazovaya A. Corynebacterium diphtheriae spoligotyping based on combined use of two CRISPR loci // Biotechnol. J. - 2007. - Vol.2. - P.901-906.

42. Jiao W. W., Mokrousov I., Sun G. Z., Li M., Liu J. W., Narvskaya O., Shen A. D. Molecular characteristics of rifampin and isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Beijing, China // Chin. Med. J. (Engl.) - 2007. - Vol.120. - P.814-819.

43. Valcheva V., Mokrousov I., Rastogi N., Narvskaya O., Markova N. Molecular characterization of Mycobacterium tuberculosis isolates from different regions of Bulgaria // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol.46. - P.1014-1018.

44. Jiao W. W., Mokrousov I., Sun G. Z., Guo Y. J., Vyazovaya A., Narvskaya O., Shen A. D. Evaluation of new variable-number tandem-repeat systems for typing Mycobacterium tuberculosis with Beijing genotype isolates from Beijing, China // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol.46. - P.1045-1049.

45. Mokrousov I., Sapozhnikova N., Narvskaya O. Mycobacterium tuberculosis coexistence with humans: making an imprint on the macrophage P2X7 receptor gene? // J. Med. Microbiol. - 2008. - Vol.57. - P.581-584.

46. Mokrousov I., Otten T., Manicheva O., Potapova Y., Vishnevsky B., Narvskaya O., Rastogi N. Molecular characterization of ofloxacin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Russia // Antimicrob. Agents Chemother. - 2008. - Vol.52. - P.2937-2939.

47. Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., Millet J., Otten T., Vishnevsky B., Rastogi N. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in Russia: in search of informative VNTR loci // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol.46. - P.3576-3584.

48. Маничева О.А., Ласунская Е.Б., Журавлев В.Ю., Оттен Т.Ф., Мокроусов И.В., Вишневский Б.И., Нарвская О.В. Лекарственная чувствительность Mycobacterium tuberculosis в сопоставлении с их жизнеспособностью, цитотоксичностью, генотипом и течением процесса у больных туберкулезом органов дыхания // Пробл. Туберк. Болезн. Легк. - 2008. - №12. - С.18-22.

49. Valcheva V., Mokrousov I., Narvskaya O., Rastogi N., Markova N. Utility of new 24-locus variable-number tandem-repeat typing for discriminating Mycobacterium tuberculosis clinical isolates collected in Bulgaria // J. Clin. Microbiol. - 2008. - Vol.46. - P.3005-3011.

50. Mokrousov I. Genetic geography of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multifacet mirror of human history? // Infect. Genet. Evol. - 2008. - Vol.8. - P.777-785.

51. Valcheva V., Mokrousov I., Narvskaya O., Rastogi N., Markova N. Molecular snapshot of drug-resistant and drug-susceptible Mycobacterium tuberculosis strains circulating in Bulgaria // Infect. Genet. Evol. - 2008. - Vol.8. - P.657-663.

52. Xiao J., Sun L., Jiao W., Li Z., Zhao S., Li H., Jin J., Jiao A., Guo Y., Jiang Z., Mokrousov I., Shen A. Lack of association between polymorphisms in the P2X7 gene and tuberculosis in a Chinese Han population // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2009. - Vol.55. - P.107-111.

53. Mokrousov I., Otten T., Zozio T., Turkin E., Nazemtseva V., Sheremet A., Vishnevsky B., Narvskaya O., Rastogi N. At Baltic crossroads: a molecular snapshot of Mycobacterium tuberculosis population diversity in Kaliningrad, Russia // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 2009. - Vol.55. - P.13-22.

54. Mokrousov I., Valcheva V., Sovhozova N., Aldashev A., Rastogi N., Isakova J. Penitentiary population of Mycobacterium tuberculosis in Kyrgyzstan: Exceptionally high prevalence of the Beijing genotype and its Russia-specific subtype // Infect. Genet. Evol. - 2009 Aug 6. [Epub ahead of print] doi: 10.1016/j. meegid. 2009.07.007 .