Историко-методологические аспекты сравнительного анализа в экологии. Меры разнообразия и близости, используемые в сравнительном анализе компонентов растительного покрова: флоры водорослей-макрофитов; субассоциации лесов р. Амур. Биоинформационная система.
Аннотация к работе
Глава 1. Схема анализа данных: основные методы 1.1 Историко-методологические аспекты сравнительного анализа в экологии 1.2 Выбор элементарного описания 1.3 Составление серии описаний 1.4 Меры разнообразия и близости, используемые в сравнительном анализе компонентов растительного покрова 1.4.1 Унарные индексы 1.4.1.1 Коэффициент вариации 1.4.1.2 Параметрические семейства унарных мер 1.4.1.3 Другие индексы для оценки разнообразия 1.4.2 Бинарные индексы 1.4.2.1 Множественная интерпретация 1.4.2.2 Дескриптивная интерпретация 1.4.2.3 Вероятностная интерпретация 1.4.2.4 Информационная интерпретация 1.4.3 Определение n-арных отношений 1.4.3.1 Множественная интерпретация 1.4.3.2 Дескриптивная интерпретация 1.4.3.3 Вероятностная интерпретация 1.4.3.4 Информационная интерпретация 1.4.4 Другие интерпретации мер конвергенций и их применение 1.4.5 Меры близости, не удовлетворяющие системе аксиом 1.4.6 Матрица абсолютных мер конвергенции 1.4.7 Матрица относительных несимметричных мер конвергенции 1.4.8 Матрица относительных симметричных мер конвергенции 1.4.9 Алгоритмы упорядочивания данных 1.4.9.1 Кластерный анализ 1.4.9.2 Диаграмма Чекановского 1.4.9.3 Неориентированные графы 1.4.9.4 Ориентированные графы 1.4.10 Интерпретация результатов Глава 2. Сравнительный анализ компонентов растительного покрова 2.1 Флоры водорослей-макрофитов дальневосточного побережья России 2.2 Субассоциации лесов поймы реки Амур 2.3 Временнaя динамика сообществ водорослей-макрофитов Глава 3. Биоинформационная система «Биоразнообразие» 3.1 Базы данных, содержащие компоненты биоразнообразия 3.2 Программы для обработки биологических данных 3.3 Информационно-справочная система по биоценометрии с комментариями Заключение Список литературы ПРИЛОЖЕНИЯ Приложение А. Математические основания теории мер близости А.1 Аксиоматический подход к введению мер. Теория S-функций А.1.1 Дивергенция и конвергенция А.1.2 Метрические относительные симметричные субаддитивные функции А.1.3 Семейство относительных мер конвергенций А.1.4 S-функции многих переменных А.1.5 Дивергенция и конвергенция многих переменных А.2 Интерпретации мер конвергенции и дивергенции А.2.1 Интерпретации направленных мер конвергенции и дивергенци А.2.1.1 Меры включения и невключения двух множеств А.2.1.2 Меры включения и невключения двух дескриптивных множеств (наборов) А.2.1.3 Меры односторонней совместимости и несовместимости событий А.2.1.4 Меры односторонней зависимости и независимости случайных величин А.2.2 Интерпретации симметричных мер конвергенции и дивергенции А.2.2.1 Меры сходства и различия двух множеств А.2.2.2 Мера сходства и различия двух дескриптивных множеств А.2.2.3 Мера совместимости и несовместимости двух событий А.2.2.4 Меры взаимной зависимости и взаимной независимости двух случайных величин Приложение Б. Начиная с XX века (особенно его второй половины), в рамках многих научных направлений, таких как сравнительная флористика, геоботаника, экология и многих других можно отметить устойчивую тенденцию активного внедрения математических методов сравнительного анализа количественных показателей (Oosting, 1953; Greig-Smith, 1957; 1964; 1983; Savage, 1960; Sokal, Sneath, 1963; Kershaw, 1964; Lambert, Dale, 1964; Williams, Dale, 1965; Грейг-Смит, 1967; Roux, Roux, 1967; Peters, 1968; Александрова, 1969; Василевич, 1969; Cancella da Fonseca, 1969; Cheetham, Hazе1, 1969; Pielou, 1969; 1975; 1977; Сёмкин, 1973 а, б; 1975; 1977; 1987 а, б; Терентьев, 1975; Goodall, 1973; Sneath, Sokal, 1973; Шмидт, 1980; Юрцев, Сёмкин, 1980; Песенко, 1982; Legendre, Legendre, 1983; Kershaw, Looney, 1985; Digby, Kempton, 1987; Magurran, 1988; 2004; Миркин, Розенберг, Наумова, 1989; Мэгарран, 1992; Уланова, 1995; Юрцев и др., 1999; Малышев, 1987; 1999; Chao et al., 2000; Koleff, Gaston, Lennon, 2003; Шитиков, Розенберг, Зинченко, 2005; Diserud, Odegaard, 2007 и др.), компьютерных методов обработки биологической информации, создания тематических биоинформационных систем и баз данных по компонентам биоразнообразия (Сёмкин, 1994; Сёмкин и др., 1995; Сёмкин, Варченко, Орешко, 1995; Сёмкин и др., 1997; Компьютерные…, 1995; 1997; Пяк, Зверев, 1997; Зверев, 1998; Марина, Марин, 1998; Юрцев, 1998; Малышев, 2002; Крестов, 2005 и др.). Первые попытки формализации таксономического состава сообществ (флор, фаун и др.) множествами и определение с их помощью отношений (общности, сходства, различия, включения, невключения), отдельных фракций видов (общие виды двух флор (фаун), дифференциальных видов одной флоры (фауны) относительно другой, дифференциальных видов двух флор (фаун) и т.д.) были осуществлены ещё в 70-х годах прошлого века (Тамарин, Шмидт, 1975; Сёмкин, 1977; 1983 а, б; Юрцев, Сёмкин, 1980; Юрцев, 1982; 1987; Юрцев, Камелин, 1987 а, б; 1991). В экологии и других науках в настоящее время отсутствуют адекватные методики исследования структуры биологических систем, которые бы учитывали особенности естественного континуума, требования теории измерений, включали бы полный цикл исследования (от постановки цел