Анализ репродуктивного поведения и индекса максимально возможного естественного отбора уйгуров сельской популяции Уйгурского района Алматинской области Республики Казахстан. Определение местоположения популяции уйгуров на филогенетическом древе.
Аннотация к работе
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии Министерства Здравоохранения республики Казахстан Популяционно-генетическая структура и генетическая дифференциация Уйгурской сельской популяции Республики КазахстанРабота выполнена в Научном центре акушерства, гинекологии и перинатологии Министерства Здравоохранения республики Казахстан Галкина Варвара Александровна, кандидат медицинских наук, Федеральное государственное бюджетное учреждение «Медико-генетический научный центр» Российской академии медицинских наук, ведущий научный сотрудник научно-консультативного отдела Защита состоится 2012 г. на заседании Диссертационного ученого совета Д 001.016.01 при Федеральном государственном бюджетном учреждении «Медико-генетический научный центр» Российской академии медицинских наук (115478, Москва, ул. С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Федерального государственного бюджетного учреждения «Медико-генетический научный центр» Российской академии медицинских наук по адресу: 115478, Москва, ул.Для исследования генофондов современных популяций человека и механизмов, определяющих генетическое разнообразие внутри популяций и различия между ними, популяционная генетика широко использует полиморфизм ДНК ядерного генома, что дает сбалансированную характеристику генофонда популяции в целом и позволяет выявить объективную картину генетического разнообразия популяции (Excoffier L. et al., 1996; Хуснутдинова Э.К., 1999). Впервые изучены генетико-демографические параметры формирования популяционной структуры и факторы, обусловливающие генетическую дифференциацию сельской популяции Уйгурского района Алматинской области, выявлено, что популяция Уйгурского района ранга сельский округ с преимущественно уйгурским населением относится к растущему типу с расширенным воспроизводством населения; анализ компонент максимально возможного естественного отбора в уйгурской популяции отражает наличие адаптивных комплексов и приспособленности в популяционной системе с низким давлением естественного отбора за счет дифференциальной плодовитости. Впервые определены параметры микроэволюции тестируемой популяции ранга сельский округ на основании анализа брачно-миграционной структуры (параметры изоляции расстоянием Малеко, индекс эндогамии, уровень инбридинга), свидетельствующие о генетической дифференциации сельских округов Уйгурского района и характеризующиеся высокой долей однонациональных браков, низкой интенсивностью и радиусом миграций, высоким уровнем локального родства, положительной брачной ассортативностью по национальному признаку. Объектом исследования была выбрана сельская популяция Уйгурского района Алматинской области Республики Казахстан с общей численностью 62 981 человек, состоящая из 14 сельских округов, основная часть населения в которых (60 - 94,4 %) представлена уйгурами, отличающаяся по своим размерам, географическому расположению, демографическим и социальным характеристикам. По представительству основных национальностей (уйгуры и казахи), можно выделить сельские округа с преимущественно уйгурским населением - Аксуский (92,57 %), Аватский (87,35 %), Кольжатский (82,50 %), Тигерменский (68,58 %), Бахарский (67,65 %), Чарынский (63,28 %), Чунджинский (56,99 % уйгур); с преимущественно казахским населением - Сумбинский сельский округ (99,81 %), Кыргызсайский (70,35 %), Актамский (59,48 %) и Таскарасуский (58,26 % казахов) сельские округа; и сельские округа со смешанным населением - Дардамтинский (50,29 % казахи и 49,54 % уйгуры), Кетменский (54,74 % казахи и 44,6 % уйгуры), Молодехканский (51,29 % казахи и 47,86 % уйгур) сельские округи.Популяция Уйгурского района ранга сельский округ с преимущественно уйгурским населением (60 - 94,4 %) относится к растущему типу (в среднем дорепродуктивная и репродуктивная группа составляют - 82,16%) с расширенным воспроизводством населения (общая плодовитость уйгурок равна 5,0, среднее число живорождений - 4,13 и эффективный размер семьи - 3,65). Анализ брачной структуры свидетельствует о генетической дифференциации сельских округов Уйгурского района и характеризуется высокой долей однонациональных браков (86,11% - 97,59%), низкой интенсивностью и радиусом миграций (доля внешних миграций в среднем составила 0,99%; ?=125,099), высоким уровнем локального родства (от 0,0005 в Чунджинском сельском округе до 0,00946 в Кольжатском), положительной брачной ассортативностью по национальному признаку (4,21).
Вывод
1. Популяция Уйгурского района ранга сельский округ с преимущественно уйгурским населением (60 - 94,4 %) относится к растущему типу (в среднем дорепродуктивная и репродуктивная группа составляют - 82,16%) с расширенным воспроизводством населения (общая плодовитость уйгурок равна 5,0, среднее число живорождений - 4,13 и эффективный размер семьи - 3,65).
2. Анализ брачной структуры свидетельствует о генетической дифференциации сельских округов Уйгурского района и характеризуется высокой долей однонациональных браков (86,11% - 97,59%), низкой интенсивностью и радиусом миграций (доля внешних миграций в среднем составила 0,99%; ?=125,099), высоким уровнем локального родства (от 0,0005 в Чунджинском сельском округе до 0,00946 в Кольжатском), положительной брачной ассортативностью по национальному признаку (4,21).
3. Анализ компонент максимально возможного потенциального отбора в уйгурской популяции (Itot=0,232) отражает наличие адаптивных комплексов и приспособленности в популяционной системе с низким давлением естественного отбора в основном за счет дифференциальной плодовитости (If=0,187) и в меньшей степени - дифференциальной смертности (Im=0,038).
4. Элементарной популяционной единицей уйгурской сельской популяции является группа сельских округов, что подтверждается матрицей генетических расстояний по модели изоляции расстоянием Малеко и индексом эндогамии (в среднем 0,9). Уровень локального родства в сельских округах Уйгурского района отражает величину их эффективного размера (r=-0,456) и индекса эндогамии (r=0,839).
5. Определены популяционные частоты генотипов и аллелей Alu-инсерционных локусов (PV92, YA5NBC27, YA5NBC148, APOA1,ACE), генов предрасположенности к мультифакториальной патологии (TNF-А, TP53, ITGB3) для уйгурской популяции. Установлен высокий уровень общего генетического разнообразия Ht=0,4598, относительно низкий уровень генетической подразделенности Gst=0,0127 изученной сельской популяции, что позволяет рассматривать уйгуров как единую этническую систему.
6. Оценка генетических взаимоотношений по панели Alu-инсерционных локусов позволила установить, что уйгуры на филогенетическом древе занимают промежуточное положение между европеоидными и монголоидными популяциями, тяготея к последнему компоненту.
Список литературы
Статьи, опубликованные в изданиях, рекомендованных ВАК: 1. Байысбекова А.Г., Березина Г.М., Кирикбаева М.С., Ельчинова Г.И. Брачно-миграционная характеристика уйгуров Алматинской области // Медицинская генетика, 2011. Т. 10. № 1 (103). С. 25-28.
2. Кирикбаева М.С., Байысбекова А.Г., Березина Г.М., Ельчинова Г.И. Этническая ассортативность и интенсивность метисации казахстанских уйгуров // Вестник Московского университета. Серия 23. Антропология, 2011. № 1. С. 84-87.
3. Байысбекова А.Г., Березина Г.М., Святова Г.С. Изучение генетической структуры популяции уйгур по данным полиморфизма Alu-полиморфных локусов // Медицинская генетика, 2012. Том 11. №1 (115). С.36-39.
4. Байысбекова А.Г. Индекс Кроу и витальные статистики уйгурской сельской популяции // Вестник Московского университета. Серия 23. Антропология, 2012. № 1. С.124-129.
Публикации в других изданиях: 6. G. Berezina, G. Svyatova , A. Bayisbekova, Z.Makhmutova. The Analysis of the Nuclear Genes Polymorphism"s in Uigurs // Genetics - Understanding living systems. XX International congress of genetics . Berlin, Germany, 2008. P.153
7. G.Berezina, G. Svyatova, А. Bayisbekova, Kirikbayeva M. Genetic Structure of Rural Population of Kazakhstan // «European Journal of Human Genetics». The European Human Genetics Conference 2008 in Barcelona, 2008. V 16. Suplement 2. P. 380.
8. Байысбекова А.Г., Березина Г.М. Оценка уровня инбридинга в сельской популяции Уйгурского района Алматинской области // Материалы конференции акушеров-гинекологов «Репродуктология и перинатология: современный взгляд на проблему». Алматы, 2009. С.166-167.
9. Байысбекова А.Г., Березина Г.М. Индекс Кроу в сельской популяции Уйгурского района Алматинской области // Материалы 1 Республиканского съезда медицинских генетиков Казахстана. Алматы, 2009. С.29-30.
10. Байысбекова А.Г., Березина Г.М. Генетико-демографическая структура сельской популяции Уйгурского района Алматинской области // Здоровье и болезнь, 2009. № 4. С.16-22.
11. Байысбекова А.Г., Березина Г.М. Формирование генетической структуры популяции Уйгурского района Алматинской области // Материалы XIII Международной научной конференции, 26.04.-03.05.2009. Хургада, Египет, С. 65-66.
12. G. Berezina, A. Bayisbekova, G. Svyatova, Z. Makhmutova. Analysis of polymorphism at three nuclear genome DNA loci in uigurs // European Human Genetics Conference 2010 Gothenburg, Sweden, June 12 -15, 2010. ESHG-EMPAG, 2010. A - 472. P. 267.
13. A. G. Baysbekova, G. M. Berezina. Genetic structure of rural population Uygur region of Almaty area, of Kasakhstan // European Human Genetics Conference 2010 Gothenburg, Sweden, June 12 - 15, 2010. P.265.
14. Кирикбаева М.С., Березина Г.М., Байысбекова А.Г. Брачно-миграционные характеристики сельских округов Уйгурского и Жамбылского районов Алматинской области // Материалы Республиканской научно-практической конференции «Эффективные перинатальные технологии в улучшении репродуктивного здоровья». 2010, Актау. C.316.
15. Байысбекова А.Г. Казакстан Республикасы ?й?ыр ауданыны? Малеко ?ашы?ты?пен о?шалау моделіні? к?рсеткіші / Медицина, 2010. 37-38.
16. Байысбекова А.Г. Параметры модели изоляции расстоянием Малеко Уйгурского района республики Казахстан // Известия НАН РК. «Серия биологическая и медицинская", 2010. C.67-69.
17. Байысбекова А.Г. Брачная структура и уровень инбридинга в сельской популяции Уйгурского района Алматинской области Республики Казахстан // Материалы 14 Международной научной конференции, 28 апреля-5 мая, 2010 года, Римини, Италия. Стр. 55-57.
18. Байысбекова А.Г. Основные параметры сельской популяции Уйгурского района Алматинской области Республики // Материалы 6 съезда Российского общества медицинских генетиков, 2010. С.17.
19. Кирикбаева М.С., Байысбекова А.Г., Махмутова Ж.С., Березина Г.М., Святова Г.С. Сравнительный анализ частоты del 32 п.н. в локусе CCR5 в популяциях казахов и уйгуров Алматинской области // Материалы международной научной конференции « Современное состояние генетики в Казахстане», 2010. С.132.