Исследование связи полиморфизма гена ИЛ10-1082 GA с заболеванием рожей у лиц казахской национальности. Генетическая предрасположенность к туберкулезу легких. Связь хронического вирусного гепатита С с полиморфизмом -1082G/А. Анализ полученных результатов.
Аннотация к работе
Полиморфизм гена ИЛ-10 в положении-1082G/A у больных рожейМатериалы и методы: Полиморфизм гена ИЛ10-1082 GA изучен у 206 больных рожей и 422 лиц контрольной группы. Результаты нашего исследования показали, что как у больных рожей, так и у лиц контрольной группы чаще встречались G аллель (ОШ = 0.87; 95% ДИ: 0.68-1.12) и GG генотип (ОШ = 0.86; 95% ДИ: 0.61-1.19). При сравнении больных первичной рожей (группа случая) и лиц контрольной группы, а также больных рецидивирующей рожей (группа случая) с лицами контрольной группы также наблюдались статистически не значимые результаты. Предрасположенность к туберкулезу легких связывают с генотипами GG (T-330G) гена IL2; CT и TT (С-590Т) гена IL4, АА (C-592A) гена ИЛ-10; GA и АА (G-308A) гена TNF А; TT (С-509Т) гена TGF-? и АА ( 874А/Т) гена IFN-? [7]. Предполагаемая связь хронического вирусного гепатита С с полиморфизмом-1082 G/А, в частности, с GG генотипом была выявлена в исследованиях, проведенных в иранской популяции, тогда как генотип GA определялся чаще среди лиц контрольной группы[21].По результатам исследования частоты встречаемости аллелей и генотипов полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) нами выявлено, что у больных рожей аллель G полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) встречается чаще по сравнению с Исследование частоты встречаемости генотипов показало, что наиболее часто определялись GG и AG генотипы, а генотип AA редко, причем как у больных рожей так и у здоровых лиц. Статистически значимых различий по частоте встречаемости аллелей и генотипов между группами случая и контроля не выявлено (таблица 1). Результаты нашего исследования по ассоциации полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) с заболеванием рожей показало, что в группе случаев шансы иметь С или Т аллели, а также СС, СТ и ТТ генотипы статистически знамо не отличались от таковой в группе контроля. Результаты нашего исследования показали, что частота встречаемости аллелей и генотипов полиморфизма гена ИЛ-10 среди больных рожей и лиц контрольной группы статистически значимо не отличались.
Вывод
полиморфизм ген больной рожа
Средний возраст больных, генотипированных по полиморфизму гена ИЛ-10 rs1800896 составил 51,5 лет (95% ДИ: 49,7 - 53,4). Средний возраст лиц контрольной группы составил 42,4 (95% ДИ: 41,2 - 43,6). Количество женщин и мужчин среди больных рожей было 111 (53,9%) и 95 (46,1%), соответственно. Среди лиц контрольной группы количество женщин составило 176 (41,7%), а мужчин - 246 (58,3%).
Распределение аллелей и генотипов в группе случаев и контролей соответствовало равновесию Харди-Вайенберга (р=0,27 и р=0,11, соответственно).
По результатам исследования частоты встречаемости аллелей и генотипов полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) нами выявлено, что у больных рожей аллель G полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) встречается чаще по сравнению с A аллелем. Среди лиц контрольной группы также G встречался чаще по сравнению аллелем А. Исследование частоты встречаемости генотипов показало, что наиболее часто определялись GG и AG генотипы, а генотип AA редко, причем как у больных рожей так и у здоровых лиц. Статистически значимых различий по частоте встречаемости аллелей и генотипов между группами случая и контроля не выявлено (таблица 1).
Таблица 1.
Соотношение частот встречаемости аллелей и генотипов полиморфизмов генов ИЛ10 (rs1800896) у больных рожей и у здоровых лиц. rs1800896 Случаи (n=206) Контроли (n=422) ?2 Р
Аллели G A 66,2% 33,7% 69,2% 30,8% 1.10 0.29
Генотипы GG AG AA 45,6% 41,3% 13,1% 49,5% 39,3% 11,1% 1.02 0.6
Примечание: ?2- значение Хи-квадрат Пирсона, р- достигнутый уровень значимости.
Результаты нашего исследования по ассоциации полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) с заболеванием рожей показало, что в группе случаев шансы иметь С или Т аллели, а также СС, СТ и ТТ генотипы статистически знамо не отличались от таковой в группе контроля.
Статистически значимой ассоциации полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) с первичной и рецидивирующей рожей также не выявлено. Шансы наличия аллелей и генотипов в группе случаев значимо не отличались при сравнении с контрольной группой.
Данные по результатам исследования связи генетического маркера (ИЛ10 (rs1800896)) с развитием рожи и ее рецидивирующего течения представлены в таблице 2.
Таблица 2.
Связь полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) с заболеванием рожей
Сравниваемые группы Аллели/ генотипы ?2 р ОШ (95% ДИ)
Больные рожей (n=206) и лица контрольной группы G 1.10 0.29 0.87 (0.68-1.12)
A 1.14 (0.89-1.47)
GG 1.02 0.6 0.86 (0.61-1.19)
AG 1.08 (0.77-1.52)
AA 1.20 (0.73-2.00)
Первичная рожа (n=143) и лица контрольной группы G 0.10 0.75 0.95 (0.71-1.27)
A 1.05 (0.79-1.40)
GG 0.49 0.78 0.90 (0.61-1.31)
AG 1.15 (0.78-1.69)
AA 0.94 (0.51-1.73)
Рецидивирующая рожа(n=63) и лица контрольной группы G 2.69 0.1 0.72 (0.49-1.07)
A 1.38 (0.94-2.04)
GG 3.34 0.19 0.76 (0.45-1.30)
AG 0.95 (0.55-1.64)
AA 1.88 (0.93-3.77)
Примечание: ?2- значение Хи-квадрат Пирсона, р - достигнутый уровень значимости, ОШ - отношение шансов.
Обсуждение
Результаты нашего исследования показали, что частота встречаемости аллелей и генотипов полиморфизма гена ИЛ-10 среди больных рожей и лиц контрольной группы статистически значимо не отличались. Ассоциации заболевания рожей с полиморфизмом гена ИЛ10 (rs1800896) в позиции -1082 GA не выявлено.
Наше исследование имеет ряд недостатков, в первую очередь, связанных с дизайном исследования. В исследованиях типа «случай - контроль» не исключается наличие систематических ошибок [3]. Отбор группы случаев и контрольной группы проводился в пределах г. Семей. В связи с этим, мы не можем экстраполировать наши результаты на всю казахстанскую популяцию. Также изза «ошибок памяти», некоторые лица контрольной группы могли не вспомнить о перенесенной ранее (в детском возрасте) роже. В третьих, в данном исследовании не учитывалось воздействие других факторов риска, то есть не учитывался эффект потенциальных конфаундеров. В нашем исследовании мы не учитывали экологические и другие факторы, которые тоже могут иметь связь с заболеванием. Однако, их связь с изучаемыми генотипами маловероятна, поэтому конфаундинг-эффект можно считать незначительным.
Также к недостаткам нашего исследования можно отнести малый объем выборки. Отсутствие взаимосвязи рожи с полиморфизмом гена ИЛ10(rs1800896) в позиции -1082 GA, возможно, было связано с малым объемом выборки. Также соотношение случая к контролю составляло 1:2. Возможно, соотношение 1:3 или 1:4 (случая к контролю) позволило бы выявить ассоциацию данного полиморфизма с заболеванием рожей.
Тем не менее, несмотря на потенциальные недостатки, наше исследование имеет выраженные достоинства. Нами впервые определен полиморфизм rs1800896 гена ИЛ-10 в казахской популяции. Однако результаты наших исследований по частоте встречаемости аллелей и генотипов полиморфизм гена ИЛ10 (rs1800896) в позиции -1082 GA у лиц контрольной группы, не совпадают с данными базы SNP , согласно которой частота встречаемости генотип АА достигает до 90% среди азиатской популяции, в то время как в нашем исследовании лиц контрольной группы АА генотип встречался лишь в 11,1%. Возможно, это связано с тем, что наши исследования были проведены только у лиц казахской национальности, проживающих в регионе города Семея, тогда как азиатская популяция включает и лиц других национальностей, проживающих в других регионах.
В то же время, Емельянова и соавт. [4] в своем исследовании, проведенном среди жителей Забайкальского края, выявили, что частота встречаемости А аллеля полиморфизма гена ИЛ10 (rs1800896) в позиции -1082 GA у больных рожей была в 5 раз выше по сравнению с контрольной группой. Однако, авторами[4] не указаны уровни статистической значимости (р) для данных различий. В нашем исследовании частота встречаемости А аллеля была незначительно выше среди больных рожей, но эти различия не были статистически значимыми. Кроме этого, авторами[4] выявлено, что у больных рожей чаще встречаются АА и GA генотипы. В свою очередь, наше исследование показало, что как у больных рожей, так и у здоровых лиц наиболее часто встречаются. GG и GA генотипы. Что же касается связи полиморфизма с заболеванием, то авторы[4] считают, что полиморфизм ГЕНАИЛ10 (rs1800896) в позиции -1082 GA повышают риск развития рецидивирующих форм рожи, но в то же время, показатели расчета ОШ не представлены. Расчет ОШ в нашем исследовании не выявило статистически значимой связи данного полиморфизма с заболеванием рожей, а также с ее рецидивирующим течением.
ИЛ-10 - противовоспалительный цитокин, продуцируется преимущественно активированными Th-2 - лимфоцитами, моноцитами, макрофагами В-лимфоцитами, основная функция которого заключается в изменении иммунного ответа с Th-1 на Th-2 [5]. Значимую роль ИЛ-10 играет в патогенезе вирусных инфекций. Немало исследований посвящено изучению ИЛ-10 при вирусных инфекциях [5,8,1], в частности, при вирусных гепатитах [8,20].
Наибольший интерес представляют исследования полиморфизма rs1800896 гена ИЛ10 в позиции -1082 G/А, которые также показывают значимую ассоциацию этого полиморфизма с вирусными инфекциями, в частности, с хроническим вирусным гепатитом С. Некоторые авторы предполагают [21, 11], наличие у носителей GG генотипа предрасположенности к хроническим вирусным гепатитам С. В то время как генотип GA, может быть ассоциирован с протективным эффектом этого полиморфизма при хроническом вирусном гепатите С [12]. Однако, в нашем исследовании нам не удалось выявить значимой ассоциации полиморфизма гена ИЛ10 с заболеванием рожей.
Таким образом, полиморфизм гена ИЛ10 (rs1800896) в позиции -1082 GA не ассоциируется с рожей у лиц казахской национальности. Необходимы дальнейшие исследования с увеличением объема выборки.
Список литературы
1. Бедарева Т.Ю. Изменения цитокинового статуса в остром периоде клещевых нейроинфекций у детей // Бюллетень сибирской медицины. 2009. №1. С.10-14.
2. Бекенова Н.Б., Гржибовский А.М., Муковозова Л.А., Смаил Е. М., Токаева А.З., . Полиморфизм rs8193036 гена ИЛ-17А в казахской популяции и его связь с продукцией ИЛ-17А у больных рожей // Экология человека. 2016. №. 4. С.50-55.
3. Гржибовский А.М.. Иванов С.В., Горбатова М. А. Исследования типа «случай-контроль» в здравоохранении // Наука и Здравоохранение. 2015. № 4. С. 5-17.
4. Емельянова А.Н., Витковский Ю.А., Кижло Л.Б. , Калинина Э.Н. Прогностическое значение генетического полиморфизма молекул Il-2 (Т330G), Il-10 (С819Т), Il-10 (G1082A) у больных рожей в Забайкальском крае // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2012. № 21. С. 159-163.
5. Иванов В.В., Шипилов М.В. Интерлей-кин-10 и острые респираторные вирусные инфекции // Здоровье - основа человеческого потенциала-проблемы и пути их решения. 2011. №. 1. С.101-106.
6. Костина Е.М., Молотилов Б.А., Баранова Н.И., Левашова О.А. Особенности полиморфизма генов цитокинов ИЛ-4, ИЛ-10, ИЛ-17 А и ФНО - ? у больных с различными клинико-патогенетическими вариантами инфекционнозависимой бронхиальной астмы // Аллергология и иммунология. 2013. №1. С. 5-9.
7. Ризванова Ф. Ф. и др. Генетическая диагностика: полиморфизм генов цитокинов // Практическая медицина. 2010. №. 6. С.41-43.
8. Юрко Е.В. Характеристика цитокинового обмена у пациентов c ко-инфекцией ВИЧ/ХГС // Міжнародний медичний журнал. 2014. №. 20. С.72-74.
9. Alvarado-Arnez L. E. Amaral E.P ., Sales-Marques C ., Durгes S. M ., Cardoso C.C ., Nunes Sarno E ., Pacheco A.G ., Lana F.C ., Moraes M.O . Association of IL10 Polymorphisms and Leprosy: A Meta-Analysis //PLOS one. 2015. Vol. 10(9). Р.1-13.
10. Brooks D. G, Trifilo M. ., Edelmann K.,Teyton L, Mc. Gavern D.B, Oldstone M.B. Interleukin-10 determines viral clearance or persistence in vivo // Nature medicine. 2006. Vol. 12(11). Р. 1301-1309.
11. da Silva N. M, Germano F.N, Vidalez -Braz B.M, Carmo Zanella Rd, dos Santos D.M, Lobato R, de Martinez A.M. Polymorphisms of IL-10 gene in patients infected with HCV under antiviral treatment in southern Brazil //Cytokine. 2015. Vol. 73(2). Р. 253-257.
12. Gao Q. J., Liu D.W., Zhang S.Y, Jia M, Wang L.M, Wu L.Y, Wang S.Y, Tong L.X. Polymorphisms of some cytokines and chronic hepatitis B and C virus infection //World J Gastroenterol. 2009. Vol. 15(44). Р. 5610-5619.
13. MCGUIRE W., Hill A.V., Allsopp C.E., Greenwood B.M, Kwiatkowski D. Variation in the TNF-? promoter region associated with susceptibility to cerebral malaria// Nature. 1994. Vol. 371(6497). P. 508-511.
14. Meenakshi P., Ramya S, Shruthi T, Lavanya J, Mohammed H.H., Vijayalakshmi V, Sumanlatha G. Association of IL?1? 3954 C/T and IL?10?1082 G/A Cytokine Gene Polymorphisms with Susceptibility to Tuberculosis // Scandinavian journal of immunology. 2013. Vol. 78(1). Р. 92-97.
15. Mira J. P, Cariou A, Grall F, Delclaux C, Losser M.R, Heshmati F, Cheval C, Monchi M, Teboul J.L., Richй F ., Leleu G ., Arbibe L ., Mignon A ., Delpech M .,Dhainaut J.F . Association of TNF2, a TNF-? promoter polymorphism, with septic shock susceptibility and mortality: a multicenter study // Jama. 1999. Vol. 282(6). Р. 561-568.
16. Mosaad Y. M., Soliman O. E ., Tawhid Z. E ., Sherif D. M . Interferon?gamma 874 T/A and Interleukin?10?1082 A/G Single nucleotide Polymorphism in Egyptian Children with Tuberculosis // Scandinavian journal of immunology. 2010. Vol. 72 (4). P. 358-364.
17. Nadel S., Newport M. J ., Booy R ., Levin M . Variation in the tumor necrosis factor-? gene promoter region may be associated with death from meningococcal disease // Journal of Infectious Diseases. 1996. Vol. 174(4). Р. 878-880.
18. Pereira V. A., Sбnchez-Arcila J.C ., Teva A ., Perce-da-Silva D.S ., Vasconcelos M. P ., Lima C. A ., Aprнgio C. J ., Rodrigues-da-Silva R. N ., Santos D.O ., Banic D. M ., Bonecini-Almeida M. G ., Lima-Jъnior J. C ., Oliveira-Ferreira J . IL10A genotypic association with decreased IL-10 circulating levels in malaria infected individuals from endemic area of the Brazilian Amazon // Malaria journal. 2015. Vol. 28(14). Р. 1-12.
19. Rattanasiri S.,Mc Daniel D.O ., Mc Evoy M ., Anothaisintawee T ., Sobhonslidsuk A ., Attia J ., Thakkinstian A . The association between cytokine gene polymorphisms and graft rejection in liver transplantation: a systematic review and meta-analysis // Transplant immunology. 2013. Vol. 28(1). Р. 62-70.
20. Rolly S. Chawla Y.K ., Verma I ., Kaur J . Association of interleukin-10 with hepatitis B virus (HBV) mediated disease progression in Indian population // The Indian journal of medical research. 2014. Vol. 139(5). P. 737 - 745.
21. Sepahi S. Pasdar A ., Ahadi M ., Gerayli S ., Rostami S ., Meshkat Z . Haplotype Analysis of Interleukin-10 Gene Promoter Polymorphisms in Chronic Hepatitis C Infection: A Case Control Study // Viral immunology. 2014. Vol. 27(8). Р. 398-403.
22. Sodsai P., Surakiatchanukul T ., Kupatawintu P ., Tangkitvanich P ., Hirankarn N . Association of cytokine and cytokine receptor gene polymorphisms with the risk of chronic hepatitis B // Asian Pacific Journal of Allergy and Immunology. 2013. Vol. 31(4). Р. 277-285.
23. Wu J. F., Ni Y. H ., Lin Y. T ., Lee T. J ., Hsu S. H ., Chen H. L ., Tsuei D. J ., Hsu H. Y ., Chang M. H . Human interleukin-10 genotypes are associated with different precore/core gene mutation patterns in children with chronic hepatitis B virus infection // The Journal of pediatrics. 2011. Vol. 158(5). Р. 808-813.
24. Yee L. J., Tang J ., Herrera J ., Kaslow R. A , van Leeuwen D. J . Tumor necrosis factor gene polymorphisms in patients with cirrhosis from chronic hepatitis C virus infection // Genes and immunity. 2000. Vol. 1(6). Р. 386-390.
25. Zhang T. C., Pan F. M ., Zhang L. Z ., Gao Y. F ., Zhang Z. H ., Gao J ., Ge R ., Mei Y ., Shen B. B ., Duan Z. H ., Li X . A meta-analysis of the relation of polymorphism at sites? 1082 and? 592 of the IL-10 gene promoter with susceptibility and clearance to persistent hepatitis B virus infection in the Chinese population // Infection. 2011. Vol. 39(1). Р. 21-27.
26. Zhu Q. R., Ge Y. L ., Gu S. Q ., Yu H ., Wang J. S ., Gu X. H ., Fei L. E ., Dong Z. Q . Relationship between cytokines gene polymorphism and susceptibility to hepatitis B virus intrauterine infection // Chinese medical journal. 2005. Vol. 118(19). Р. 1604-1609.