Программное обеспечение для осуществления моделирования биохимических и генетических процессов в клетке. Математическая модель динамики изменения объема и потенциала эритроцита. Симуляция гибели эритроцита методом фиксации трансмембранного потенциала.
Аннотация к работе
Каждая биологическая система обладает свойством саморегуляции, то есть способностью перестраиваться в зависимости от внешних воздействий так, чтобы сохранился оптимальный уровень ее функционирования. Существуют различные способы регуляции жизнедеятельности клетки, которые можно условно отнести к генетическому, биохимическому и физиологическому уровням регуляции. В результате этих процессов изменяются концентрации различных веществ, численность отдельных клеток, биомасса организмов или, например, величина трансмембранного потенциала в клетке. Целью работы стало: - изучение и освоение основ работы современных программных обеспечений для осуществления моделирования всех биохимических и генетических процессов в клетке - построение математической модели динамики изменения объема и потенциала эритроцита в зависимости от концентраций проникающих ионов и рН внеклеточной среды на базе ранее созданной модели для липосомы Выполняя построение математической модели, мною были поставлены следующие цели: - осуществить расчет изменения потенциала, объема, водного потока и концентраций проникающих ионов эритроцита в зависимости от внеклеточного рН - осуществить симуляцию гибели эритроцита методом фиксации трансмембранного потенциала - исследовать скорость изменения потенциала, объема, водного потока и концентраций проникающих ионов эритроцита в зависимости от низких показателей внеклеточного рН (0,3 - 0,9) Глава 1. Обзор литературы клетка эритроцит биохимический моделирование Первые математические модели биологических систем были созданы еще в начале ХХ века, однако более подробно начать обзор данных моделей следует с рассмотрения интегральной модели регуляции объема, рН и ионного содержания эритроцитов, созданной В. Это дает возможность гибко воспроизводить любые экспериментальные разработки, оптимизируя таким образом направление количественного сравнения между экспериментально измеренным и предсказанным моделью результатом. Также программа обладает следующими возможностями: 1) Графическое изображение метаболической сети в состоянии равновесия потоков и размеров пулов; 2) Нахождение состояния равновесия системы; 3) Временная калибровка метаболической сети; 4) Моделирование метаболических путей.