Основные правила систематической номенклатуры ферментов. Разделение ферментов на классы в зависимости от типа реакции. Структура систематического названия оксидоредуктаз. Ферменты, катализирующие перенос остатков фосфорной кислоты и ее ангидридов.
Аннотация к работе
Согласно рациональной номенклатуре, простой фермент называли по названию субстрата с добавлением окончания-аза (ДНКАЗА , РНКАЗА , амилаза, уреаза ). 3-я цифра - подподкласс (в зависимости от типа кофермента, реагента или особенностей реакции) 4-я цифра - порядковый номер фермента в пределах данного подподкласса .Итак, все ферменты разделяют на 6 классов в зависимости от типа реакции: 1. Поскольку многие окислительно-восстановительные реакции обратимы, а прямую и обратную реакцию катализирует один и тот же фермент, то условлено, что в качестве субстрата для построения названия фермента выбирается метаболит , являющийся донором электронов, т.е. субстрат, подвергающийся окислению.Тривиальные (рабочие) названия оксидоредуктаз имеют следующую структуру: приставка - название субстрата, корень - название группы оксидоредуктаз . цистеин:кислород-оксидоредуктаза , тривиальное - цистеиндиоксигеназа .НОМЕНКЛАТУРА ТРАНСФЕРАЗ Трансферазы катализируют реакции переноса различных радикалов от молекулы-донора к молекуле-акцептору, общая схема которых приведена ниже: Д-Г А -Д Г-А где: ? Д-Г-молекула донор группы Г, ? А-молекула акцептор, ? Г-переносимая группа А , Д ? Н2О - реакции гидролиза, которые также соответствуют этой схеме, выделены в отдельный класс.Например, метилтрансферазы (реакции биологического метилирования - перенос метильных групп), гликозилтрансферазы (катализируют реакции переноса остатков сахаров на различные акцепторы), ферменты переносящие азотисные группы (трансаминазы - играют важную роль в обмене аминокислот), ферменты переносящие фосфатные группы.Систематические названия ферментов класса трансфераз строятся следующим образом: название донора группы : название акцептора группы - название переносимой группы - название класса (тире между названием переносимой группы и названием класса не ставится). Тривиальные названия ферментов, катализирующих реакции переноса фосфорсодержащих групп определяются фрагментом молекулы АТФ, которая переносится на субстрат.тривиальная номенклатура - киназы , систематическая - фосфотрансферазами . тривиальная - пирофосфокиназами , систематическая - дифосфотрансферазами . если переносится остаток нуклетида , то такие ферменты и по систематической и по тривиальной номенклатурам называются нуклеотидилтрансферазами .Образование глюкозо-6-фосфата из глюкозы и АТФ (первая реакция процесса гликолиза ): Систематическое название КФ 2.7.1.1.