Явление кругового дихроизма. Методы анализа спектров кругового дихроизма белков. Инфракрасные спектры поглощения белков. Поглощение белков в ИК-области. Методы анализа ИК-спектров белков. Работа с пакетом программ STRUC по анализу ИК-спектров белков.
Аннотация к работе
1. Спектры кругового дихроизма белков 1.1 Явление кругового дихроизма 1.2 Методы анализа спектров кругового дихроизма белков 1.3 Работа с пакетом программ STRUCTURE по анализу спектров КД белков 2. Инфракрасные спектры поглощения белков 2.1 Поглощение белков в ИК-области 2.2 Методы анализа ИК-спектров белков 2.3 Работа с пакетом программ STRUC по анализу ИК-спектров белков Список литературы Введение Хромофоры белковых молекул (то есть химические группы в молекуле белка, ответственные за поглощение света на определенных длинах волн) можно разделить на три класса: пептидные группы, боковые группы аминокислотных остатков и простетические группы. Спектроскопические методы исследования вторичной структуры белка основаны на изучении спектров именно пептидных хромофоров, поскольку конформация пептидных групп и определяет тот или иной тип вторичной структуры белка - a-спираль, b-структуру и др. Как показывают эксперименты, простая адсорбционная спектроскопия белков в неполяризованном ультрафиолетовом свете мало пригодна для анализа вторичной структуры белка. Спектры КД более удобны для использования на практике, поскольку содержат узкие, хорошо разрешимые полосы. КД различных типов вторичной структуры белка можно оценить по результатам измерения КД гомополипептидов известной конформации (например, поли-L-лизина), после чего определить вклад каждой из структур в спектр КД исследуемого белка. Вместо этого в качестве базисных берут спектры КД белков, структура которых известна из данных рентгеноструктурного анализа. Различные подходы к анализу исследуемого спектра КД на основе этого базисного набора определяют различия между методами, которые будут описаны ниже. 1.2 Методы анализа спектров кругового дихроизма белков Метод эталонных спектров [2,3]. (1.2.2) Эталонные спектры для всех структурных форм могут быть вычислены на основании набора базисных спектров КД (спектров белков с известной вторичной структурой - коэффициентами ) с помощью метода наименьших квадратов и формулы (1.2.1), примененной к каждому базисному спектру.