Обмеження продуктивного фагового розвитку з боку бактерії-хазяїна. Особливості функціональної несумісності автономних генетичних елементів в клітинах E. carotovora. Модель для ідентифікації внутрішньоклітинних систем рестрикції-модифікації E. carotovora.
Аннотация к работе
НАЦІОНАЛЬНА АКАДЕМІЯ НАУК УКРАЇНИРобота виконана у відділі молекулярної біології вірусів Інституту мікробіології і вірусології ім. Науковий керівник - доктор біологічних наук, старший науковий співробітник Товкач Федір Іванович, Інститут мікробіології і вірусології ім. Заболотного НАН України, завідувач відділом молекулярної біології вірусів. Офіційні опоненти - доктор біологічних наук, професор, член-кореспондент НАН України, Малюта Станіслав Станіславович Інститут молекулярної біології та генетики НАН України, завідуючий відділом молекулярної генетики; Захист відбудеться 19 вересня 2007 року о 12 годині на засіданні Спеціалізованої вченої ради Д 26.233.01 Інституту мікробіології і вірусології ім.Автономні генетичні елементи (АГЕ) бактерій включають острови патогенності, бактеріофаги, плазміди, транспозони, IS-елементи та RM-системи, які являють собою сегменти ДНК, здатні до внутрішньо-та міжгеномного розповсюдження. Все ж фаги, плазміди і транспозони E. coli не вичерпують всього різноманіття АГЕ і тому їх вивчення в інших бактеріях є актуальним. Робота виконувалась в рамках науково-дослідних тем відділу молекулярної біології вірусів Інституту мікробіології і вірусології НАН України: “Молекулярно-генетична організація та біотехнологічне застосування лізогенних систем Erwinia carotovora” (державний реєстраційний номер теми 0105U000788), “Одержання антилейкемічної L-аспарагінази з Erwinia carotovora” (державний реєстраційний номер теми 0104V003200 0102V003706) і “Отримання і використання макромолекулярних бактеріоцинів (каротоворіцинів) Erwinia carotovora для біоконтролю в оточуючому середовищі” (державний реєстраційний номер теми 0102V003706). Основною метою роботи було встановлення особливостей функціональної несумісності автономних генетичних елементів в клітинах E. carotovora. Робота виконувалась в рамках сучасної концепції несумісності автономних генетичних елементів: фагів, плазмід, RM-систем (Hatfull, 2000; Novick, 1987; Kobayashi, 2001).Фагочутливі штами E. carotovora subsp. carotovora характеризуються наявністю систем рестрикції-модифікації, які обмежують продуктивний розвиток фага ZF40 на 5 - 6 порядків. Ці системи є унікальними для ентеробактерій і на їх функціонування не впливають екзогенна RM-система плазміди PECL18 і продукт гена ard екзогенної плазміди РКМ101. На основі коліфага Т7 і полівалентного фага FE44 запропоновано систему для виявлення та типової ідентифікації рестрикції-модифікації E. carotovora та E. coli.