Вивчення молекулярно-генетичного поліморфізму сортів сої різного еколого-географічного походження методами полімеразної ланцюгової реакції. Аналіз дискримінаційного потенціалу використаних методів. Розробка методу паспортизації досліджених генотипів сої.
Аннотация к работе
НАЦІОНАЛЬНА АКАДЕМІЯ НАУК УКРАЇНИ ІНСТИТУТ МОЛЕКУЛЯРНОЇ БІОЛОГІЇ І ГЕНЕТИКИ УДК 575.174.015.3:633.57 Автореферат дисертації на здобуття наукового ступеня кандидата біологічних наук ПЛР - АНАЛІЗ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОГО ПОЛІМОРФІЗМУ КУЛЬТУРНОЇ СОЇ (Glycine max L.) 03.00.26 - молекулярна генетика БРИК Олександр Федорович Київ - 2002 Дисертація є рукопис. Офіційні опоненти: доктор біологічних наук, професор, член-кореспондент НАН України Кунах Віктор Анатолійович, Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, завідувач відділу генетики клітинних популяцій; кандидат біологічних наук Комарницький Ігор Климентійович, Інститут клітинної біології і генетичної інженерії НАН України, старший науковий співробітник відділу цитофізіології і клітинної біології. Розрізняють спрямовану (із залученням пари праймерів) і ПЛР з одиничними довільними праймерами (ДП-ПЛР). Найбільший інтерес у варіантів першого типу викликає метод SSRP (simple sequence repeats polymorphism). Інший тип ПЛР представлений в основному методами ДП-ПЛР ( arbitrary primed PCR) і ISSR ( inter-simple sequence repeat). SSR-маркери численні, мають кодомінантний тип успадковування і стабільно відтворювані. Предмет дослідження - молекулярно-генетичний поліморфізм ДНК культурної сої. Для дослідження молекулярно-генетичного поліморфізму сортів культурної сої та їх подальшої паспортизації з колекції відділу селекції сої СГІ отримано 32 сорти з різних еколого-географічних зон: 8 сортів американського походження: Провар, Анока, Капітал, Магна, Амсой, A-100, Блекхок, Ада; 8 сортів далекосхідного походження: Грібовська місцева, Амурська 42, Амурська 111, Амурська 57, Амурська 51, Амурська 321, Амурська 154, Амурська 347; 8 сортів китайського походження: К 2601, Харбінська, К 2441, Ларедо, К 766, К 2408, Тзи-ті 4, К 2406; сорти європейського походження: Ронест 104, Маусерова біла, Ронест 1, Дунайка, К 3-382, КZ-26, TSZ 14, Попельсдорфер. Інкубували на водяній бані протягом 1 години при 60 0С. Умови ПЛР, гель-електрофорез, візуалізація ампліконів. Середній рівень очікуваної гетерозиготності для кожного типу маркерів обчислювали за формулою: Hav= SHex/np Оскільки ДП-ПЛР і ISSR методи полілокусні, а SSRP-аналіз монолокусний, то для їх порівняння найобєктивнішим є використання маркерного індексу (MI) (Powell et al, 1996): MI=E Hav , де E - рівень полілокусності, що визначається як добуток числа одночасно аналізованих незалежних ПЛР-локусів по одній доріжці гелю на фракцію поліморфних ПЛР-локусів (співвідношення поліморфних ПЛР-локусів до суми поліморфних і неполіморфних ПЛР-локусів). За допомогою використаних праймерів виявлено три ПЛР-фрагменти, що були кодомінантними.